M. Morsi avait été condamné à la peine de mort en juin 2015 pour son rôle dans des évasions massives de prison et des attaques contre la police durant la révolte qui a chassé Hosni Moubarak du pouvoir en 2011.
Mardi, la cour de cassation a également annulé les condamnations d'au moins cinq des coaccusés de M. Morsi, dont l'ancien guide suprême des frères musulmans Mohamed Badie.
Dans le même procès, près d'une centaine d'autres personnes avaient aussi été condamnées à la peine capitale par contumace. Ces personnes ne sont pas concernées par l'annulation prononcée par la cour mardi.
Au total, M. Morsi a été condamné à quatre reprises depuis sa destitution par l'armée en 2013.
Dans un procès pour espionnage au profit du Hamas palestinien, du Hezbollah libanais et de l'Iran, l'ex-président avait été condamné à la prison à vie.
M. Morsi avait aussi écopé de 20 ans de prison pour des violences contre des manifestants durant sa courte mandature.
Enfin, dans une dernière décision rendue en juin 2016, il a été condamné de nouveau à la prison à vie avec 10 coaccusés pour le vol de "documents relevant de la sécurité nationale" et leur livraison au Qatar, selon l'acte d'accusation.
M. Morsi est détenu à la prison de Borg-el-Arab près d'Alexandrie.
